Σε ένα από τα ακριτικότερα φυλάκια του ελληνισμού, το Αγαθονήσι, όπου η ιστορία, ο πολιτισμός και η εθνική παρουσία παραμένουν διαχρονικά άρρηκτα συνδεδεμένα, εγκαινιάστηκε το Διαχρονικό Αρχαιολογικό Μουσείο, το 33ο κατά σειρά νέο ή πλήρως ανακαινισμένο μουσείο που αποδίδει στο κοινό το Υπουργείο Πολιτισμού, από το 2019.
Η ίδρυσή του αποτελεί μια σημαντική επένδυση στη διαφύλαξη της πολιτιστικής μας κληρονομιάς και ταυτόχρονα μια έμπρακτη επιβεβαίωση της διαρκούς παρουσίας της Πολιτείας στα ακριτικά νησιά του Αιγαίου.
Στον χαιρετισμό της η Υπουργός Πολιτισμού Λίνα Μενδώνη, σημείωσε:
Η υλοποίηση του έργου δεν προχώρησε την περίοδο 2015-2019. Το 2020, όμως, μας δόθηκε η δυνατότητα να συνεχίσουμε από το σημείο που το είχαμε αφήσει, εντάσσοντας την ολοκλήρωση του κτηρίου και της μόνιμης έκθεσής του στο Ταμείο Ανάκαμψης. Η υλοποίηση έργων στα μικρά και ακριτικά νησιά μας είναι πάντοτε απαιτητική, τόσο ως προς τη χρηματοδότηση όσο και ως προς τη διαθεσιμότητα των ανθρώπινων πόρων. Ωστόσο, αυτό το Μουσείο έπρεπε να γίνει. Είναι καθήκον του Υπουργείου Πολιτισμού να δημιουργεί σύγχρονες πολιτιστικές και μουσειακές υποδομές στα ακριτικά νησιά μας. Το Αιγαίο υπήρξε το λίκνο, το χωνευτήρι όλων εκείνων των πολιτισμικών ρευμάτων που διαμόρφωσαν τη μεγάλη ιστορική διαχρονία του ελληνικού πολιτισμού.
Το Μουσείο αναπτύσσεται σε δύο επίπεδα, παρουσιάζοντας τη διαχρονική ιστορία του νησιού, με επίκεντρο τα ευρήματα από το Καστράκι.
Στο ισόγειο εκτίθενται αντικείμενα από τις διάφορες φάσεις του οχυρού, καθώς και τεκμήρια κατοίκησης ήδη από την 3η χιλιετία π.Χ. Στον όροφο αναδεικνύονται θεματικές ενότητες για την πολεμική και καθημερινή ζωή, τις παραγωγικές δραστηριότητες (μελισσοκομία, μεταλλουργία, βυρσοδεψία, αγγειοπλαστική), το εμπόριο, τις αρχαίες λατρείες, τη βυζαντινή περίοδο και τη σύγχρονη ζωή στο Αγαθονήσι, με τη χρήση πλούσιου οπτικοακουστικού υλικού.
Η δημιουργία και η ολοκλήρωση του Μουσείου πραγματοποιήθηκε σταδιακά μέσω χρηματοδοτήσεων από το πρόγραμμα INTERREG «Ελλάδα–Κύπρος», το Εθνικό Πρόγραμμα Ανάπτυξης του Υπουργείου Πολιτισμού και το Ταμείο Ανάκαμψης και Ανθεκτικότητας. Παράλληλα, υλοποιήθηκαν έργα ανάδειξης του αρχαιολογικού χώρου και ολοκλήρωσης των εκθεσιακών υποδομών, με συνολικό προϋπολογισμό που ξεπερνά τα 2,8 εκατ. ευρώ.