Η είδηση της απώλειας του Στέφανος Ληναίος, που έφυγε από τη ζωή σε ηλικία 98 ετών, σκόρπισε βαθιά θλίψη στον καλλιτεχνικό και πολιτικό κόσμο. Ο ίδιος υπήρξε μία από τις πλέον σεβαστές προσωπικότητες – λόγω του ήθους και της δημοκρατικής πολιτικής του δράσης κατά την περίοδο της χούντας -, όσο και επιδραστικές μορφές του νεοελληνικού θεάτρου, με μια διαδρομή που εκτείνεται σε περισσότερες από επτά δεκαετίες.
Οι συνοδοιπόροι του συνεργάτες στο Θέατρο Άλφα Ληναίος Φωτίου τον αποχαιρετούν με μεγάλη συγκίνηση: «Το Θέατρο Άλφα Ληναίος-Φωτίου, οι εργαζόμενοι και συνεργάτες του αποχαιρετούν με θλίψη και ευγνωμοσύνη τον Στέφανο Ληναίο. Ο δικός μας «κύριος Στέφανος», στην χώρα των αθανάτων πια, μας αφήνει σπουδαία θεατρική παρακαταθήκη, παράλληλα με την ενεργή πολιτική του παρουσία και τα παρεμβατικά κείμενα-άρθρα του. Θα τον θυμόμαστε και θα τον αγαπάμε. Εκφράζουμε τα ειλικρινή μας συλλυπητήρια στην επί 63 χρόνια σύντροφό του, Έλλη Φωτίου, τα παιδιά και τα εγγόνια του».
Ο Στέφανος Ληναίος άφησε την τελευταία του πνοή στο σπίτι του, έχοντας στο πλευρό του την αγαπημένη του σύζυγο, Έλλη Φωτίου. Σύμφωνα με την επιθυμία του, η αποτέφρωσή του πραγματοποιήθηκε την Τετάρτη 22 Απριλίου σε στενό οικογενειακό κύκλο στο Αποτεφρωτήριο Ριτσώνας και ανακοινώθηκε κατόπιν (η οικογένεια, η σύζυγός του Έλλη, ο γιος του Αλέξανδρος και η κόρη του Μαργαρίτα, σεβάστηκαν την επιθυμία του να μην δημοσιοποιηθεί αμέσως ο θάνατός του).
Η κόρη του, Μαργαρίτα Μυτιληναίου, ραδιοφωνική παραγωγός, τον αποχαιρέτησε με μια συγκινητική ανάρτηση, αναφέροντας χαρακτηριστικά: «Καλό σου ταξίδι, πατέρα. Έφυγες πλήρης και πλήρης ημερών, χαμογελαστός και γεμάτος αγάπη. Θέατρο, ραδιόφωνο, κείμενα σε εφημερίδες, βιβλία, συνδικαλισμός. Σε όλα άφησες το ισχυρό σου αποτύπωμα». Η Υπουργός Πολιτισμού Λίνα Μενδώνη τον αποκάλεσε «ηθοποιό μεγάλου διαμετρήματος» που υπηρέτησε την τέχνη «με δέος και σεβασμό», ενώ συλλυπητήρια μηνύματα απέστειλαν και τα πολιτικά κόμματα.